感染由血源性微生物引起(血源性骨髓炎)；从感染组织扩散而来；包括置换关节的感染,污染性骨折及骨手术。.最常见的病原体是革兰氏阳性菌，如金黄色葡萄球菌，溶血性链球菌，其次是革兰氏阴性菌。革兰氏阴性菌引起的骨髓炎可见于吸毒者,镰状细胞血症患者和严重的糖尿病或外伤患者。真菌和分枝杆菌感染者病变往往局限于骨，并引起无痛性的慢性感染。
危险因素包括消耗性疾病、放射治疗、恶性肿瘤、糖尿病,血液透析及静脉用药.对于儿童,任何引起菌血症的过程都可能诱发骨髓炎.骨的感染伴发血管阻塞时,会引起骨坏死和局部感染扩散.感染可穿过骨皮质播散至骨膜下,并形成皮下胀肿,后者会自发性穿透皮肤引流。
重庆贻青中医院认为：骨髓炎属于中医学附骨疽之范畴，其致病因素，概括起来可分为内因和外因两大类。
（1） 内因：包括内伤七情和饮食劳伤两个方面。七情过度刺激，可影响内脏的功能，使其发生紊乱，气血淤滞，淤毒内生，发生“疽变”。此类多以思，忧，郁，怒为常见。五味不节，恣食膏梁厚味及刺激之品，可使脾胃功能失调，湿热内蕴，炎毒内生，灼筋伤骨，发为骨疽。房劳过度，肾精内伤，肾气虚弱，正气不足，风寒湿邪乘虚浸袭，脉淤血滞，亦可为患。
（2） 外因：可分为六淫所伤和外来伤害两个方面。六淫尤以风、寒、湿、火邪致病为多。风、寒、湿皆可化火，炎毒内伤，便可生疽。故《外科心法》有痈疽原是火毒生"之说。凡跌打损伤，金刃创伤，水火烫伤，虫害咬伤皆属外来伤害，也可成疽。