病理改变与一般外伤性骨髓炎大致相同。主要是：
①残端缝合肌肉的缝线，以缝合线为中心形成炎性脓胞及炎症病灶。
②神经痛，主要是截断神经残端增生瘢痕，神经断端受压迫，创口处及负重处可引起剧烈的疼痛。
③残端血肿，主要是肌肉断端出血或术中止血不适，术后引流不畅所造成。
④骨髓内炎症从截骨断端直到近端骨的干骺部，髓腔内充满炎症及肉芽组织。
⑤皮肤缺损、骨外露，见于残端裂开的病人，也为残端皮肤坏死骨外露。
⑥关节继发感染，波及性化脓性关节炎，甚至关节软骨坏死、关节破坏。
⑦关节屈曲、畸形、不能伸直。
⑧截肢残端骨髓炎合并同一肢体上部骨髓炎。
例如：小腿胫骨截肢后合并胫骨骨髓炎。 重庆贻青中医院的专家提醒患有骨髓炎的患者在选择治疗方法时应慎重，以免造成不必要的后果。
在重庆贻青中医院主要采用以“靶位定向体液疗法”中医外治骨髓炎：
1、提脓拔毒 专属药效使坏死组织脱落、液化、将积存在病灶区内的各种至炎因子，随脓液通过窦道排除体外，改善瘀滞肿胀状态，调节又降低组织的酸化程度达到改善内环境。
2、穿透性杀菌 专属药效在局部形成柱状辐射环，持续、恒定于患区，而专属药效具有多靶点、重靶点起到强力的杀菌、抑菌作用，使病患区的毒性降低、防御机能增强。
3、专属药效使血管网、淋巴管网建立与畅通，病患区在得到营养物质的供应，促进肉芽组织、新生骨、扶正固本、增加骨与软组织的愈合能力，从里向外愈合，达到根本治疗骨髓炎的目的。